我们在用培养皿细菌培养的时候，首先由于细菌无处不在，因此从制备培养基时开始，整个培养过程必须按无菌操作要求进行，否则外界细菌污染标本，会导致错误结果；而培养的致病菌一旦污染环境，就会引起交叉感染。

因此培养皿要经过高温灭菌，并且每一组的培养皿要在相同的环境条件下培养。经过高温处理后可以将培养皿上、培养基内混有的细菌或真菌的孢子等杀死（经过严格的高温灭菌的环境中是不可能有细菌和真菌存在的），这样就排除了实验外其他环境的污染。

用培养皿设备培养时应根据细菌种类和目的等选择培养方法、培养基，制定培养条件（温度、pH值、时间，对氧的需求与否等）。一般操作步骤为先将标本接种于固体培养基上，做分离培养。再进一步对所得单个菌落进行形态、生化及血清学反应鉴定。培养基常用牛肉汤、蛋白胨、氯化钠、葡萄糖、血液等和某些细菌所需的特殊物质配制成液体、半固体、固体等。一般细菌可在有氧条件下，37℃中放18～24小时生长。厌氧菌则需在无氧环境中放2～3天后生长。个别细菌如结核菌要培养1个月之久。

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